Pamiątki po nieistniejących już krakowskich świątyniach, a także odkrycia archeologiczne związane z kościołem św. Wojciecha można oglądać na kameralnej ekspozycji w podziemiach tego budynku na Rynku Głównym. Wystawa stała Muzeum Archeologicznego w tym miejscu zmieniła się po 17 latach.